پس از موافقت كلي مركز و مدرسه عالي امام خميني (ره)فراخواني جهت عضوگيري برگزار گرديد و از يكايك طلاب تاريخ اسلام مدرسه براي همكاري در اين انجمن دعوت به عمل آمد. پس از فراخوان جهت عضوگيري، اكثريت طلاب عضو در مورخة 7/12/1384در انتخاباتي با نظارت معاونت محترم پژوهش، ‌اداره ساماندهي تحقيقات و گروه تاريخ اسلام به صورت رسمي اعلان موجوديت كرد. در اين رأي‌گيري هيئت مديرة اصلي و علي البدل و هيئت ناظر طبق اساسنامة‌مصوب به شرح زير با رأي مخفي انتخاب گرديد آقايان مجاهد گيتاري، ‌سيد جمال موسوي، جعفر نوري، سيدعليرضاعالمي و عبدالقادر كمالي به‌عنوان هيئت مديره اصلي و اظهر حسين زيدي و طاهر سيف الدين به عنوان اعضاي علي البدل. آقايان تورگوت آتام و مرتضي حسيني بعنوان ناظران انجمن انتخاب شدند .

در اولين جلسات هيئت‌هاي مديره و ناظران، وظايف اعضاي انجمن مشخص و تشريح گرديد و در آن خط مشي انجمن و اولويت‌هاي آن طبق وظايف محوله در اساسنامه انجمن، مد نظر قرارگرفت.

عملكردهاي انجمن بعد از اين مصوبات به شرح زير مي‌باشد:

1- براي تمامي طلاب داراي عضويت اصلي( پيوسته) در انجمن پروندة فعاليت تحقيقي و پژوهشي و عملكرد اجرايي افتتاح گرديد.
2- يك دستگاه رايانه و پرينتر با هزينة ‌شخصي، براي راه اندازي سايت و فعاليتهاي اجراي مانند تايپ تحقيقات و پژوهشها خريداري شد.
3- تهيه فضا و آدرس براي تأسيس سايت علمي براي طلاب و پژوهشگران گروه تاريخ اسلام
4- راه اندازي آزمايشي سايت علمي دانش پژوهان تاريخ به مدت 45 روز با آدرس: http://www.islamichistory.ir/ با مديريت فني آقاي مهدي هاشمي از اعضاي فعال انجمن
5- راه اندازي دائمي سايت انجمن دانش پژوهان تاريخ پس از برطرف كردن اشكالات فني آن.

اين سايت اولين سايت علمي جامعه المصطفي العالميه به شمار مي‌آيد. رويكرد و هدف عمده سايت، درج مقالات پژوهشي طلاب و اساتيد محترم مدرسه است و سعي دارد تا جديدترين مقالات در زمينة‌ مطالعات تاريخي را ارائه دهد. لذا بخش مقالات آن در سه رشته‌: تاريخ تشيع، تاريخ معاصر و تاريخ تمدن اسلامي فعال است. براي اولين بار تلاش شده تا وقايع روزانه تاريخ اسلام با مستندات تاريخي به صورت ماهانه تهيه و در سايت قرار گيرد، هم چنين در اين سايت قسمتي به معرفي كتابهاي تاريخي به صورت مستند اختصاص يافت، براي مثال در سال 85 كه از سوي رهبر معظم انقلاب اسلامي به عنوان سال پيامبر اعظم(ص) نامگذاري شده بود، معرفي كتابهاي تاريخي در ارتباط به زندگي پيامبر اعظم مد نظر قرار گرفت. اين سايت در راستاي پيشبرد اهداف علمي و پژوهشي خود با بسياري از دانشجويان دانشگاههاي ديگر [ايران و خارج از ايران] ارتباط مستمر دارد. سايت فعلا ً‌ تنها به زبان فارسي فعال است. انجمن با علم و توجه به اين مهم كه سايت علمي مي‌تواند پشتوانه خوبي براي فارغ التحصيلاني كه به كشورهاي خود باز مي‌گردند، باشد، درصدد است، تا آن‌را به زبانهاي ديگر مانند عربي، ‌تركي و اردو نيز فعال سازد. همچنين در تلاش است تا قسمت پاسخ به شبهات تاريخي را نيز در سايت راه اندازي كند .تا به صورت روزانه با مخاطبين خود در تماس باشد.

6- انجمن سعي كرده تا با گروه تاريخ اسلام تعاملات خوبي داشته باشد و نظرات و پيشنهادات طلاب محترم را به گروه منعكس كند و در بر پايي جلسات عمومي و نشست‌هاي علمي كه از سوي گروه تاريخ برگزار مي‌گردد، مشاركت فعال نمايد.
7- اين انجمن در فعاليت‌هاي مجمع انجمن‌هاي مدرسه اشتراك مي‌ورزد و رئيس هيئت مديرة‌ آن در هيئت مديره مجمع انجمن‌ها ي مدرسه عضو فعال مي باشد و در جلسات آن شركت كرده و نقطه نظرات انجمن را منعكس مي‌كند. و در تصميم‌گيري‌ها و اقدامات جمعي در زمينه‌هاي فرهنگي و پژوهشي اشتراك مي‌ورزد.
8- دفتر انجمن علمي دانش‌پژوهان تاريخ، روزانه براي مراجعه اعضاي انجمن و ساير مراجعين باز است و پيوسته يكي از اعضاي هيئت مديره انجمن در آنجا حضور دارد، برخي از ساعات بعد از ظهر نيز اتاق انجمن به دليل پشتيباني سايت باز مي‌باشد. انجمن از نقطه نظرات طلاب و اساتيد در جهت پيشبرد اهداف انجمن استفاده مي‌كند. از سوي ديگر نفس حضور طلاب در دفتر انجمن، مي‌تواند روحيه همگرايي و انسجام در بين طلاب گروه تاريخ را باعث شود.

9- انجمن سعي دارد تا با نشريات مدرسه عالي امام خميني(ره) در زمينه كارهاي پژوهشي و تهية‌ مطالب و پژوهشهاي ميداني همكاري و مساعدت مستمر داشته باشد. در اين قسمت با مجله آفاق بصورت پژوهشهاي ميداني و ارائه پژوهشهاي طلاب و مجلة‌ علمي طلوع با ارائه مقالات طلاب همكاري دارد.

10- انجمن سعي دارد تا با جامعه المصطفي العالميه نيز در زمينه كارهاي پژوهشي تعامل داشته باشد به همين دليل در سال پيامبراعظم(ص) مطالب مستندي تحت عنوان پيامبراعظم در آينة دانشوران شيعه با تحقيق چندتن از دانش‌پژوهان تهيه و در مراكز مختلف جامعه المصطفي العالميه توسط اداره ساماندهي تحقيقات توزيع ‌گرديد و قرار است تا در آينده نزديك به صورت يك كتاب مستقل انتشار يابد.

11-انجمن در يك طرح تحقيقاتي، در صدد است، تا روزشمار مستند تاريخي، براي تاريخ اسلام تهيه كند. اين طرح تا كنون به مدت يكسال دنبال شده است و تلاش مي‌ورزد تا آن را ادامه بدهد تا براي اولين بار يك روز شمارقمري جامع و مستند براي تاريخ اسلام تهيه شود . اين سالشمار بصورت مرتب در سايت انجمن و در بُردهاي مدرسه نيز قرار مي‌گيرد. با هماهنگي امكان دارد اين كارها در تمام مراكز جامعه المصطفي نيز عملي گردد.

12- انجمن علمي با مشاركت معاونت پژوهش تا به حال چندين نشست علمي در تالار قدس مدرسه عالي امام خميني (ره) برگزار كرده است كه برخي عبارتند از:

الف - نشست علمي اول در تاريخ 2/9/1385 تحت عنوان امام رضا (ع) و تشيع خراسان،‌ همراه با ميزگرد علمي.

ب - نشست علمي دوم در تاريخ 17 /2/1386 تحت عنوان تشيع و افغانستان امروز، كه مندرجات آن در فصلنامه پژوهشي طلوع مدرسه امام خميني(ره) به چاپ رسيده است .

با توجه به عملكرد و فعاليتهاي مثبت و سازندة‌ انجمن، در دورها‌ي دهم و يازدهم جشنواره پژوهشي شيخ طوسي انجمن دانش‌پژوهان تاريخ به عنوان انجمن برتر برگزيده شد.

سياست هاي آتي انجمن :

1.برگزاري كارگاه‌هاي آموزشي و پژوهشي با استفاده از اساتيد مجرب

2.برگزاري متون تخصصي زبان‌هاي انگليسي و عربي

3. تقويت سايت انجمن و افتتاح آن به زبان‌هاي ديگر

4. برقراري ارتباط و هماهنگي با انجمن هاي داخلي جامعه مصطفي العالميه و ساير مراكز آموزشي و پژوهشي

5.تلاش براي انتشار نشريه علمي انجمن

6. تشكيل هيئت علمي منسجم و كارآمد و نخبه از ميان دانش پژوهان گروه تاريخ.